时光代理人第一季于7月9日完结，并宣布第二季制作决定
故事发生在地处偏远的私立八光学园之中，一直以来，八光学园都以极为严明的校风，以及培养真正的淑女而闻名遐迩。然而，自2011年4月起，学园由单纯的女校改为了男女混校，五位并不“高贵”亦不“纯洁”的男生首次踏上了这片从未遭受过“污染”的“圣地”。 各方面都只能用平凡来形容的藤野清志（神谷浩史 配音）、喜欢研究三国志的诸葛岳人（小西克幸 配音）、清志的中学好友若本真吾（铃村健一 配音）、身体虚弱沉默寡言的根津让二（浪川大辅 配音）和抖M宅男安堂丽治（兴津和幸 配音），当这胆大包天的五人决心进行女子澡堂偷窥行动而后彻底暴露被捕之时，等待着他们的竟然是冰冷的铁窗，和来自于里学生会成员们的残酷折磨！
在已被彻底探索殆尽的世界里，名为“深渊”的大洞是硕果仅存的秘境。 这个深不见底、不知会延伸到何处的巨大垂直洞穴中，不仅栖息着各种稀奇古怪的生物，还沉睡着现今人类所做不出来的珍贵遗物。 “深渊”那处处充满不可思议的神秘样貌，吸引人们前仆后继地前去冒险。渐渐地，大家开始将那些多次挑战大洞的冒险者们称为“探窟家”。 孤儿莉可住在兴建于深渊四周的城镇“奥斯”，她梦想着将来要成为像她母亲一样伟大的探窟家，并一解深渊之谜。 某天，她母亲莱萨的白笛被人发现，让莉可因此下定决心要潜入深渊的深处。她捡到的失忆机器人雷格，也为了寻找自己的记忆而决定与她同行。 莉可在深界四层被穿珠的毒给侵蚀折磨，拯救她的是名叫娜娜奇的惨剧终末。娜娜奇加入之后，三个人便继续前往彭多尔多所在的深界五层冒险。在那里，他们遇见了一个自称普鲁修卡的女孩。由彭多尔多抚养长大的她对外界一无所知。普鲁修卡深深着迷于莉可的冒险故事，并希望能和莉可一起冒险，然而她却惨遭彭多尔多利用来做实验。 不过后来普鲁修卡改变形体，变成莉可的白笛，与她一同朝深界六层“不归之都”前进。在那里有座“惨剧终末的村子”，那是拥有自己一套价值观的惨剧终末们所生活的地方。
高三生高桥美咲（樱井孝宏 配音）被哥哥介绍来到了补习老师家，发现他居然是大名鼎鼎的小说家宇佐见秋彦（花田光 配音），外表华丽性格却恶劣有可怕的起床气，还会写些以哥哥为主角的耽美小说。美咲对秋彦的第一印象可谓糟糕透顶。但在补习之中，随着美咲对秋彦认识的加深，看到了秋彦对哥哥的痴心，爱操心烂好人的美咲渐渐对秋彦产生了感情…… 大学老师上条弘树（伊藤健太郎 配音）单恋着青梅竹马的伙伴秋彦，但最终宣告破裂。偶然机会下，遇到年下的男学生草间野分（神奈延年 配音），弘树答应做野分的家庭老师。二人在加深的交往中，逐步了解和相互吸引。但弘树能否忘记秋彦，投入到这段感情中呢？ 弘树的同事宫城庸（井上和彦 配音）和自己上司的女儿离婚了，却被从美国归来的前妻的弟弟强势告白。起先觉得麻烦的庸也在高槻忍（岸尾大辅 配音）不屈不挠的攻势下，被渐渐打动，一方面觉得这样为他拼命的忍很可爱，另一方面却仍纠结于自己的初恋。二人最终能否走在一起呢？
