人类长期以来隐藏在墙壁中的巨大秘密是——
虽然调查兵团离真相更近了一步，但由于当时的王政，被冠以了反叛者的污名。
但是，人类不仅仅是被饲养的家畜。
艾尔文·史密斯追求真相的的执念打动了宪兵团的高层，最终爆发了针对现行体制的政变。
一直欺骗民众的虚伪之王被废，继承了真正王室血统的希丝特莉亚·雷斯即位。在亲自讨伐巨人的勇敢女王的带领下，人类迎来了新的时代。
艾伦·耶格尔获得了硬质化能力和由此诞生的新型对巨人兵器。
稳步而顺利地进行反抗准备的人类，为了心中的夙愿，毅然实行了夺回玛利亚之墙的作战。
这是人类和巨人赌上彼此生存的终极之战。在那之前，艾伦、人类到底能得到什么呢？
家住千叶县的17岁普通高中生高坂京介（中村悠一 配音）有一个14岁的妹妹高坂桐乃（竹达彩奈 配音），可是，很长一段时间以来，这个外表可爱的妹妹和自己的关系并不密切，有时甚至可以用冷淡来形容。妹妹的身上究竟发生了怎样的事情呢？终于有一天，一个关于桐乃的秘密被京介发现了。 可爱 的妹妹居然是宅系的兄控？！虽然桐乃百般否认，但事实不容狡辩。随后，原本只在妹妹身边出没的千金大小姐槙岛沙织（生天目仁美 配音）和毒舌少女五更琉璃（花泽香菜 配音）也渐渐的围绕到了京介的身边来，她们都和妹妹一样，是秋叶原系的御宅族。因为是兄控而觉得分外苦闷的桐乃，究竟会和妹控的哥哥京介发展出一段怎样妙趣横生的关系呢？
毫无征兆的一天，体积庞大几乎能遮天蔽日的外星飞船突然出现在繁华都市上空。来势汹汹的外星人意图将人类文明从地球彻底抹杀。假面骑士Ex-Aid宝生永梦（饭岛宽骑 饰）和Lucky（岐洲匠 饰）率领的宇宙战队球连者携手迎击敌人，不过面对数量上占绝对优势的外星侵略者，超级英雄们的抗争孱弱无力。危急时刻，本来应该死去的假面骑士Lazer九条贵利矢（小野冢勇人 饰）及时出现并施以援手。敌人来自何方？所来为何？死去的人为何再度出现？胜利虽然遥不可及，然而超级英雄不断升级，以全身之力包围着地球的和平…… 本片在日本国内309块银幕上同时公映，首周初登场观众满意度排名第一位。
故事承接《鬼灭之刃 柱训练篇》。
