2033年,人类阻挡小行星撞击地球的计划失败了,人类灭亡了,而被遗忘在月球上的中等动物研究员独孤月幸运的活了下来,成为全宇宙最后一个人类。但这并不值得高兴,虽然月球基地物资充沛,除此之外,陪伴他的只有无尽的孤独。他开始锻炼身体、探索基地、创作漫画,不知不觉竟然将自己在月球上的孤独生活过出了乐趣。然而他不知道的是,基地摄像机将他的视频画面传回了地球,全球的幸存人类在地球上直播观看他的月球生活,并将他视为榜样。直到有一天,他发现自己没动过的蛋糕上有一个牙印.....难道月球上还有什么别的存在?
本次公开的第二季动画标题为《我的妹妹哪有这么可爱。》,乍看之下似乎与第一季没什么区别,其实区别就在于最后的一个“。”句号。本次有意将第一季标题加上句号作为第二季的标题,不得不令人联想第二季是否意味着真正完结?