从前有位“光之巨人”,他负责保卫世界和平,对抗巨型怪物和外星人入侵的威胁。他就是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联系,并在使命完成后离开了地球。时至今日,人类已进入了繁荣时代,但这只不过是和平的假象...现在,世界再次需要“光之巨人”的力量。就在这时,一个新的英雄出现了,他继承了光的基因。但是他并不高大,是一名中等身材、多愁善感的高中生,穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎,是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼,一个新的故事就此展开。
在原本是平凡生活中的一天,整个世界发生了异变,床主市街上出现大量如同丧尸般的死体,而主角小室孝所就读藤美学园的也遭到死体的袭击。为了求生小室孝集结了包含青梅竹马在内的一批人,在这如同地狱般世界中,过去的各种价值观及法律已毫无意义,为了能在这现实的世界存活下去,人们的自私、黑暗、疯狂开始渐渐浮现,而主角一行人必须抛弃从前所谓的理想,面对残酷的现实,并在这崩坏的世界求得一线生机…