“想洗清嫌疑，方法有很多，语言辩解只是其中的一种，但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法！”紫川秀，这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领，在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下，成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王，诞生了！
本次公开的第二季动画标题为《我的妹妹哪有这么可爱。》，乍看之下似乎与第一季没什么区别，其实区别就在于最后的一个“。”句号。本次有意将第一季标题加上句号作为第二季的标题，不得不令人联想第二季是否意味着真正完结？
第1集：图图设计大师 第2集：掩耳盗铃 第3集：万能创可贴 第4集：又好又坏的广告 第5集：输了赢了 第6集：购物真方便 第7集：爸爸爱摄影（上） 第8集：爸爸爱摄影（下） 第9集：写一封信 第10集：宰相肚子装什么 第11集：我有多爱你 第12集：回来吧大智 第13集：没有玩具怎么玩（上） 第14集：没有玩具怎么玩（下） 第15集：好事还是坏事 第16集：每个人的弱点 第17集：别人难过的时候 第18集：答非所问 第19集：爸爸妈妈别吵架 第20集：妈妈的节日 第21集：讨厌的选择题 第22集：我有一双亮眼睛 第23集：那个龙猫 第24集：免费礼券 第25集：壮壮哥哥的兴趣 第26集：当我还是一个小宝宝
机动战士高达SEED的系列作再开。这次除了我们大家熟悉的基拉（保志总一朗 配音）、阿斯兰（石田彰 配音）等人外，还有大量新角色的登场。而故事也将演变的更为复杂，冲突加剧，战争升级。 C.E.70年2月，“血染情人节”事件的辐射效应还在地球联合军和ZAFT中延续着。二者发动了数次对抗，伤及众多无辜百姓。C.E.71年6月，地球联合军居然不顾条约发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。这让少年真飞鸟（铃村健一 配音）在一瞬间失去了自己全部的亲人，而且都是在自己眼前。这件事对飞鸟的打击不小，让他这个无忧无虑的平凡少年，决定加入ZAFT。加入ZAFT，飞鸟遇到了许多挫折和坎坷，也看到了人性的残忍和无奈，最严峻的情况是自己内心始终笼罩着家人离去的阴影。飞鸟的成长在ZAFT正式开始。他和基拉、阿斯兰他们又会有怎样的交集呢？
