《战国BASARA》中活跃的武将们,在现代高中再次展开了激烈的战斗:前任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处分,学园内群雄割据,为争夺新会长之位成为乱世。足球社的王牌“真田幸村”、棒球部的王牌“伊达政宗”,高呼着团结就是力量的“德川家康”,矢志打倒家康的“石田三成”等人纷纷参战——这个混乱的学园,还会有明天吗?
和他同乘一班列车的少女桂言叶(冈嶋妙 配音)让伊藤诚(平川大辅 配音)久久不能忘怀,两人看似遥远的距离被日复一日的电车生活慢慢拉近了。在青少年间有一个传说,如果把喜欢的人的照片设置成为手机背景并且3个星期不被人发现的话,就可以实现成为恋人的愿望,虽然诚并不相信,但为了抒发他对言叶的感情,他仍然照做了。诚的同桌西园寺世界(河原木志穗 配音)发现了诚的秘密,热心的她决定帮助诚达成他的愿望。但在这过程中,西园寺世界发现自己对诚的感情有了微妙的变化,看着满眼只关注着言叶的诚,西园寺世界的心情非常复杂。 诚终于向言叶坦白了自己的心情,两人相约在车站见面,然而满心欢喜来到车站的诚却发现,等待着自己的是西园寺世界。天生优柔寡断的诚无法妥善的处理这复杂的三人关系,一系列不负责任的错误选择把诚推向了无法挽回的悲剧之中。
设定在“克隆人战争”之后,帕尔帕廷皇帝的统治将要开始之时,摩尔计划在一颗未被帝国染指的星球重建他的犯罪组织,而他遇上了一个理想破灭的绝地学徒,或许正是他在复仇之路上所需要的帮手。