本次公开的第二季动画标题为《我的妹妹哪有这么可爱。》，乍看之下似乎与第一季没什么区别，其实区别就在于最后的一个“。”句号。本次有意将第一季标题加上句号作为第二季的标题，不得不令人联想第二季是否意味着真正完结？
这一切，始于突如其来的退婚……出身武道名门安诺瓦兹公爵家的千金玛丽亚（昵称：咪咪），虽是最小的孩子，却因展现出“武术的才能”而被当作继承人来培养。然而随着弟弟的降生，这个职责突然就卸下了……虽然父亲严令要找个优质金龟婿，可穆罗王国内那些显赫的贵族公子早就名草有主了。走投无路之下，她投奔远房亲戚艾达，前往邻国鲁比尼王国留学并积极相亲。谁知在皇家学院的毕业派对上，素未谋面的雷纳托王子竟当众宣布解除婚约——这桩婚事她压根就不知情！明明连婚约都还没订下，玛丽亚却惨遭悔婚？！她的相亲之路将何去何从？武力派大小姐的爆笑恋爱喜剧正式开演！！
“信号塔大战”后，熊大、熊二和光头强的缩小器再度遗失。三人组合继续留守不夜城，找寻缩小器的回家之路更是状况频出，但他们从未放弃希望，最终与小动物们合力拯救小镇，呈现了一场精彩惊险的微观世界冒险之旅。
