主角秦尘本是武域中最顶尖的天才强者，却遭歹人暗算，陨落大陆禁地死亡峡谷。必死无疑的秦尘，却意外触发神秘古剑的力量…… 三百年后，天武大陆偏僻之地，一位同名少年意外继承了秦尘的意志。作为大齐国军神定武王的爱孙，却因生父来历成迷，母子二人在定武王府中受尽冷遇，相依为命。 为了重写望日的强者神话，也为了守护自己所爱的一切，秦尘毅然决然扛起维护天下五国的大任，再度踏上武道之路。
世界闻名的原子物理学家冲田彻夫（二瓶秀雄 饰）在四国山脉某处发现神秘元素“超铀”，该元素蕴含常人难以想象的能量，一旦被恶人利用制造杀人武器，将造成不可估量的后果。在返回东京的途中，冲田教授遭到秘密结社毒蝎帮绑架。得知这一消息的风见志郎（宫内洋 饰）偷偷潜入毒蝎帮所在的无人小岛，救出了教授。伤重不治的教授临死前交代风见去找他的妹妹冲田广子（森桃江 饰）寻找矿藏地图。他们一路前行，谁知毒蝎帮尾随其后。大敌当前，假面骑士V3绝不退缩！关键时刻，连假面骑士1号（藤冈弘 饰）和2号（佐佐木刚 饰）也加入战局…… 本片根据石之森章太郎的漫画原作改编。
故事发生在一个人类文明科技极度发达的未来社会，机械帝国凭借着拥有大量优秀科学家和研造出的高智能机器人称霸宇宙，巨大的机器王国就此建立。帝国之中，凤（一条和矢 配音）、华莲（绪方惠美 配音）、北斗（佐久田修 配音）和龙（藤原启治 配音）是辅佐机械皇帝的四灵将，其中，华莲于无意之中发现了皇帝可怕而又强大的野心，决定不再助纣为虐，于是带着属于她的高能机器人逃往神居岛。 在神居岛，莲花邂逅了名为高宫铁兵（桧山修之 配音）的放牧少年，之后成为了他的师父。钢太郎是铁兵的哥哥，皇帝觊觎钢太郎高超的智商将他绑架。为了救出哥哥，正直勇敢的铁兵潜入了机械王国。
