橘发少年黑崎一护是个正义感爆棚的高中生，与父亲、两个妹妹共同生活，从小他就有能看见鬼魂的本事，但并不以为意。一天夜里一只叫“虚”的怪物攻击了一护和他的家人，尾随怪物而来的死神朽木露琪亚身负重伤，只得将灵力转给一护，由他代死神之职。岂料“代职”一发不可收拾，一段时间后，尸魂界发现露琪亚的违规行为，来人将她抓走。为救出朋友，一护在浦原商店店主浦原喜助的帮助下，集结了井上织姬、石田雨龙、茶渡泰虎几位好友，一同前往尸魂界。与此同时，尸魂界瀞灵廷内一场惊天阴谋也在慢慢掀开……
守护者马丽娜失去了奇迹宝盒以及宝盒里的精灵！如今的马丽娜只剩下奇迹米可幻奇，艾俊也只剩下自己的黑猫米可幻奇。马丽娜十分自责，对自己守护者的身份和能力产生了质疑。没有了宝盒中的其它米可幻奇，超级英雄小分队再也无法一并作战，而他们的敌人却变得更加强大。影魔蝶如今称呼自己为魔煞，拿到奇迹宝盒的他与最终的胜利咫尺之遥。在掠夺过来的米可幻奇超能力的加持下，魔煞的战斗力有了极大的提升。他还打造了全民"联盟"戒指计划，企图通过这个智能设备获取奇迹少女和黑猫罗尔的蛛丝马迹。魔煞把米可幻奇能量赋予被他黑化的人，制造出更强大的超能反派。两位英雄主角孤身奋战，但他们将会比以往任何时候都更加团结。他们该如何打败强大的魔煞以及超能反派？
21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。 几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃生装置失灵。在危急关头，大伍突然化成光，和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活，并与两大怪兽展开了战斗……
