本次公开的第二季动画标题为《我的妹妹哪有这么可爱。》，乍看之下似乎与第一季没什么区别，其实区别就在于最后的一个“。”句号。本次有意将第一季标题加上句号作为第二季的标题，不得不令人联想第二季是否意味着真正完结？
正在读初三的月岛雯是一个喜欢看书的女孩，她每次都能在借书卡上看到一个叫天泽圣司名字，因此她对这个人充满了好奇。 雯一直喜欢写诗，有一天她跟好友夕子在讨论写诗的事，夕子告诉雯自己收到了情书，但事实上夕子已有了喜欢的人。更没有想到的是，夕子喜欢的杉村喜欢的是雯，雯一时间感到十分困惑。 雯无意中来到了一个小店，原来店主是圣司的爷爷。认识了圣司之后，听到了圣司对自己理想的追求之后，也激发了雯对自己理想的追求之念。当圣司离开了到意大利学习做小提琴时，雯决定要专心写作。当雯完成了作品之后，她发现原来自己高估了自己，就这样她选择继续考高中，这时她非常想念圣司。 一天凌晨，她站到窗边，突然看到了一个熟悉的身影……
在不远的未来，地球迎来了一位神秘的天外来客——帕莫，它是宇宙智慧文明希尔人的运输飞船，携带着6400万年前消失的恐龙重归地球。希尔人在将恐龙带到地球的同时，也给人类带来了先进的基因技术，人类由此进
前世叶云飞天资过人，但体内武脉突然关闭，无法练武，遭遇了家族内部的奚落，未婚妻的私通背叛，各家族的围剿，让少年叶云飞众叛亲离，好友被欺凌、挚爱伤心离开、父亲惨烈战死。好在云游路过的紫圣真君将他收入门下，叶云天成长为有史以来最年轻的天帝，却在渡劫时遭遇偷袭，重生回一切转折 发生的武脉尽失之时，却也是热血少年时代。 再次遇到旧日的亲人、好友、恋人，面对熟悉的一切，一代天帝叶云飞选择重新开始。体内尚存一缕天帝之魂，让前生记忆得以完好保存。内有名位之争，外有家族矿脉荣辱之责，举目帝国天骄聚集，四大宗派各为其势，天玄大陆豪杰并起，叶云飞熟谙这世界强者为尊的规则。在千年天帝记忆的帮助下，叶云飞的武功进步惊人，在武道世界之中不断成长，并带领家族、师门快速壮大。 安定时日未几，外来侵略者铁蹄来犯，叶云飞率众奋起反抗，保卫家园生生不息。 为了追求更高层次的武道之路，叶云飞离开家乡踏上了新的旅途，终成一代天帝。尝过太多落井下石、釜底抽薪，这一世必是神挡弑神，佛挡杀佛，横戈跃马，不负少年。
人类遭逢了名为“空间震”的新型灾害。震撼空间、将一切破坏殆尽的这一灾厄，是由于精灵自临界显现而发生的。为了阻止空间震，使人类免遭灾厄而必须采取的措施，是使用武力歼灭精灵，或者是——“与其约会，使其娇羞”！ 让精灵娇羞，再通过“亲吻”即可封印其力量——拥有这种能力的高中生·五河士道。为了人类的和平，也为了拯救精灵们——士道在和她们的“约会”中来回奔走。对士道敞开心扉的精灵·十香、四糸乃、琴里、耶俱矢、夕弦、美九，为歼灭精灵而行动的AST，企图利用精灵的DEM，尝试与精灵对话的拉塔托斯克，以及，需要令其娇羞的新精灵——将这一切全部卷入，新的战争约会开始了——
