落叶

　　有通灵本领能再现罪犯的能人郑振（任昌丁饰）是个分析力非常强的犯罪心理专家，而他的搭档有民（崔丹尼尔饰）当警察只是为了更容易吸引女粉丝，二人均对升职毫无兴趣，也因此在警局过着最碌碌无为的警察生活。就在这时警局派了他们去一个非正规的搜查队，两人不得不为根除在大韩民国的新兴宗教集团的不正之风展开行动，由于不够冷静又喜欢用拳头先解决问题，闹出不少笑话。最终两人联手揪出无视法律权威、将韩国玩弄於鼓掌之上的犯罪组织头目。

驱魔龙族马氏家族传人马小玲（吴千语 饰），肩负着除邪惩恶的家族使命。而二流侦探况天佑（黄宗泽 饰），则凭借奇特能力屡破奇案。但实际上他一直在掩饰着不死不灭疯狂噬血的“血族”身份，本来相安无事的日子，被一道“暗影”打破，两人在调查一起暗影袭击的事件中相遇，出生入死的瞬间，百年恩怨所结下的宿命之锁，似乎已悄然解开……

　　1999年，某个东西被卡车运出了馆山市。几天后，哥斯拉登陆了馆山，特生自卫队出动与之展开了苦战。在战斗中，自卫队员家城茜（釈由美子 饰）意外害死了战友叶山二尉（森末慎二 饰），自己却侥幸活了下来，并被派去了资料科。
　　另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水野久美 饰）的指挥下，召集了汤原德光（宅麻伸 饰）等科学家开始研究对付哥斯拉的G兵器。他们以在馆山冲挖掘出来的初代哥斯拉骨骼为基础，用了四年制成了机械哥斯拉——3式机龙。柘植首相辞职，由科学技术厅长官五十岚隼人（中尾彬 饰）就任新首相。同时，茜被派去了机龙队，担任机龙的操作员。
　　就在准备机龙测试机动时，哥斯拉又在东京湾出现了。机龙赶赴现场与哥斯拉对战，却因哥斯拉的吼声唤醒了体内的野兽灵魂，突然暴走，在城市中造成了大破坏。
　　为了改良机龙，汤原改变了机龙DNA计算机的碱构造，使机龙不会再受哥斯拉叫声的干扰。但由于对再次暴走的担忧，五十岚迟迟不允许出动机龙。
　　哥斯拉再度出现在东京湾，一路无视特生自卫队的攻击来到了品川，令城市变成了一片火海。面对如此情景，五十岚终于同意让机龙出动。
　　为了打败哥斯拉，机龙被送到了品川。茜也抱着必死的觉悟。机龙和茜的战斗就这样开始了。