女娲娘娘为了造福人间，创造出了能够帮助人类的神兽，哪知道邪恶而又贪婪的元始天魔利用了善良的神兽，将它们污染变为了残暴的魔兽，驱使它们祸害人间，企图就此成为统治世界的霸主。 问天（马小冀 配音）是南宫城城主的儿子，一次偶然之中，他得到了神兽天晶兽（王凯 配音），让问天没有想到的是，天晶兽竟然幻化成为了神兵，拥有着足以打败魔兽的强大力量。与此同时，问天的妹妹问雅（刘旭莹 配音）从母亲的血脉里遗传了净化之力，能够净化遭到黑暗力量侵蚀的神兽，在兄妹两人无间的配合之下，正义的势力逐渐的壮大起来。元始天魔眼看阴谋无法得逞，于是召唤出了更加强大的敌人玄天邪帝。
该季讲述了，拥有“武神躯”的少年镇魂将一一曹焱兵为寻父母下落，与少女夏铃、北落师门等队友，闯入灵域禁地芦花古楼，并与守卫者“风花雪月”四王展开激烈交锋的冒险故事。
新的一年到来，青青草原涌现了更多的乐趣。先是懒羊羊身上发生奇妙的变化，一起意外让他拥有了神奇的超能力，由此引发了无数好玩有趣的事情，也令灰太狼遭受无数磨难，苦不堪言；而灰太狼的宝贝儿子小灰灰一天天长大，为了让灰灰顺利完成成狼礼，他想出诸多诡计帮儿子抓羊。而小灰灰不仅成功进入羊村上学，还令灰太狼与小羊们达成和解。在此期间，香太狼女儿香香也隆重出场，小灰灰终于要面对狼生路上的各种抉择。 奇妙搞笑的故事不断上演，各种神奇的道具更是层出不穷，懒羊羊和小灰灰的全新戏剧轻松道来……
茶居屋里、代官的儿子和随从正在欺负客人，这时候进来一位全身充满野兽气息的流浪武士。在茶居屋工作的风被故意拌倒、茶泼到随从的身上，代官儿子正要砍掉风的手指的时候被无幻救下。另一方面、仁看不惯代官恶意欺压乡民，教训了代官一顿。其后仁在茶居屋碰到正在教训代官儿子的无幻，被无幻当作代官的手下高手而对打了起来。在一阵激烈的打斗后两人不分上下，这时茶居屋被人放火、无幻和仁在火中继续打斗直到失去意识。 两人醒来的时候、已经被代官抓住，两人被施加酷刑并定在次日被斩首。晚上风想办法去救他们，但是由於钥匙被不小心弄断了而失败。第二天行刑时、无幻和仁挣脱捆绑杀了代官，但是在重重包围下渐渐体力不支。风适时的利用烟火成功帮助两人逃脱。 刚逃出重围的无幻和仁准备分个高低但被风阻止。在投硬币后无幻和仁不得不陪风去寻找“有向日葵味道的武士”，三人的旅程至此开始。
在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。 另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化…… 与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
