在兔子洞里,灵兔白妮看到时间之窗一个接一个地消失... 未来正在消逝,到底发生了什么? 同时,马丽娜在家中醒来,发现有人利用奇迹少女与黑猫罗尔的米可幻奇许了愿。 很快,她意识到自己需要变身成奇迹少女……但她发现自己的耳环不见了! 幸运的是,灵兔白妮在愿望消除一切之前赶来救了她。为了一起拯救未来,灵兔白妮和马丽娜必须找出是谁发现马丽娜就是奇迹少女,以及这个人是何时、如何偷走她的米可幻奇的。 马丽娜意识到蝴蝶米可幻奇现在有了新主人,一切希望似乎都消失了。只有一个人能拯救巴黎和世界,那就是奇迹少女自己。
主人公莉莉娅转生到另一个世界成为一名侯爵大小姐,她的前世记忆是一个电子游戏怪物。当莉莉娅发现另一个世界存在魔法时,她的游戏精神便喷涌而出,在她还只有 0 岁、只能爬行的时候就开始了修炼。结果,莉莉娅的魔法在五岁时就达到了贤者的水平。有一天,莉莉娅被邀请到王宫,与一个人发生了命运的邂逅。
正就读中学的少年迈尔斯(沙梅克·摩尔 Shameik Moore 配音)意外被一只遭受放射性污染的蜘蛛咬伤,随后身体发生奇特的变化。偶然机缘,他目睹了蜘蛛侠(克里斯·派恩 Chris Pine 配音)和犯罪头目金并(列维·施瑞博尔 Liev Schreiber 配音)的战斗。为了阻止金并利用时空对撞机扰乱宇宙,蜘蛛侠最终壮烈牺牲。可未过多久,来自平行宇宙的颓废的彼德·帕克(杰克·约翰逊 Jake M. Johnson 配音)出现在迈尔斯面前。为了阻止金并的阴谋,并帮助这个帕克返回自己的宇宙,他们闯入金并的老巢。在这一过程中,二人遭到章鱼博士和徘徊者的狙击。与此同时,来自其他宇宙的女蜘蛛侠、暗影蜘蛛侠、蜘猪侠、二次元蜘蛛妹相继出现。 他们合力与恶势力展开斗争……