大一新生周小安戴上一枚来历不明的古代戒指，旋即一个恐怖的魔人从他口中跃出，他的命运也因此而发生了改变。 一段人类历史上的惊天秘密在他眼前缓慢揭开——自称是商王帝辛的血魔人；以人心为食物的不死尸族；自称与尸族为敌却同样可疑的天虚宫道人；充满奇异怪物却可能隐藏着人类诞生起源之谜的神迹；身上有诡异图案的神秘不死少女江玄燕……
今晚，他也在召唤出牙狼铠甲，斩杀食人魔兽霍拉。 这时，魔戒法师「古由利」（Koyori）出现了。 她告诉流牙一个危及世界的紧急状况，想要获得黄金骑士的帮助。 “破灭之门即将开启” 破灭之门被认为是霍拉最早出现在人类世界的大门。 不知为何，据说它即将再次开启。 在古由利的带领下，流牙来到了大门所在的城市克莱阿城。 在这座城市里，蔓延着“破灭之门”泄露出的黑暗气息。 流牙感觉到了邪气，并立即与霍拉交战。 激战中，一名神秘的魔戒骑士突然出现。 他就是身披“钢”铠甲的「白羽创磨」。 作为无名骑士“钢”猎杀霍拉的创磨，他的宿命是什么！？ 流牙能否阻止“破灭之门”的开启！？ 现在，一个逼近守护者的起源的气壮山河的故事拉开帷幕。
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
