古争锋本是守护神龙星的神龙,在上古与外星敌人的战斗中身受重伤故陷入了长久的沉睡。时光荏苒,再度苏醒的古争锋发现神龙星早已物是人非,而昔日受人敬仰的神龙也成了人们口中的恶龙,为了调查真相,也为了取回藏在龙王学院的宝藏,古争锋化为人形以导师的身份进入龙王学院,却阴差阳错地成为屠龙系的老师,为此古争锋一面悉心教授学员,一面努力找寻宝藏,几番调查下,古争锋发现龙王宝藏的知情人皆已离世,眼下唯一的线索可能在副院长夜江雪的手中。在接近夜江雪的过程中,古争锋多次出手协助,让夜江雪沉寂已久的内心泛起一丝涟漪,而与此同时,古争锋也被一股神秘力量盯上,躲避了多次暗杀行动后,古争锋感觉旧时的威胁正在逐步逼近,而找寻宝藏恢复力量,锻炼学员组成新的神龙军团抗击敌人迫在眉睫……
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。