《五星红旗迎风飘扬2》承接“两弹一星”的故事,从1970年4月我国第一颗人造卫星上天写起,着力塑造毛泽东、周恩来、邓小平等老一辈革命家运筹帷幄,在复杂多变和严峻的国际环境中,审时度势,从容应对,始终立于主动地位。为了维护祖国的主权、领土完整和民族尊严,他们进行的坚定而有理有力的斗争,在严重困难面前,他们带领全国人民,迎难而上,以不屈的姿态和昂扬的精神面貌去战胜和克服困难,终于走出了一条中国特色的社会主义道路。
淞沪会战爆发,厨子孟万福(黄澄澄 饰)只想求生,却被国民党抓伕充军。旅长张云魁(王阳 饰)一心报国,却因高层指挥失误陷入绝境。战场上,张云魁抱必死决心率残部突围接应援军,孟万福受其嘱托远赴南京报丧。张云魁奇迹般生还,却被国民党高层污蔑为"逃跑将军"。申诉无果的他,在与新四军团长谢语峰相遇后重燃希望,返乡组建民团抗击日寇并加入了中国共产党。与此同时,孟万福阴差阳错照顾起张家老小,与张云魁太太丁玉娇(万茜 饰)患难与共。在中共地下党员曾雪飞的引导下,两人先后投身共产革命。在民族危亡之际,无论是前线将士,还是后方百姓都看清:唯有中国共产党才能实现中华民族的救亡图存。抗战胜利,又一个中秋月圆之夜,坚韧不屈的中国人民终于守得云开见月明。
主人公吴邪(侯明昊 饰)身为老九门吴家后人,从机关重重的战国墓“七星鲁王宫”九死一生逃出生天后,回到家中发现三叔吴三省(姚橹 饰)失踪,还牵扯出十几年前的一桩考古队谜案。吴邪接到神秘的阿宁来信,为找到三叔,他前去西沙明代沉船葬海底墓寻找线索,遇到自七星鲁王宫分别的王胖子(张博宇 饰),还发现神秘古物蛇眉铜鱼,以及失忆的张起灵(成毅 饰),而小哥来到西沙海底墓似乎还另有原因。在潜入神秘的明代船墓过程,遭遇海猴子、禁婆等怪物的攻击,最终突破奇门遁甲的层层机关返回陆地。然而蛇眉铜鱼、六角铜铃的线索又将他们指引到秦岭,去探寻巨大青铜树的秘密。